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1）如果越轨广泛流传，就可能弱化人们遵从科学精神的动机。科学精神是一种群体规范，它要求每个科学家都自觉地遵守。科学家越轨行为发生又没有受到惩罚，实际上是鼓励了科学家的越轨行为。
2）越轨对其他科学家造成影响，特别是时间损失。这些时间将损失在科学家对其工作进行的仔细考察、重复实验的验证和各种调查与听证会中。更为严重的事，更多的时间将浪费在以此为基础的科学活动上。尽管科学家需要怀疑精神，但本质上他们更愿意相信科学家特别是有名望的科学家取得的阶段性成果，进行进一步的研究活动。
3）越轨会降低社会对科学家的信任和对科学的信心。正如社会应该相信警察、医生一样，社会也应该相信科学家。如果科学家花了纳税人的大量资金谎称有了科研成果，并为自己的越轨行为顽固辩护，而后真相大白，就会造成严重的影响。科学家希望享受科学共同体的自治和自我调节，要求社会对科学活动的干预越少越好，而越来越多的越轨行为正在降低科学家的职业声誉，社会干预将变得更具说服力。
4）越轨可能有害，还因为越轨使生活不可预知而充满危险，因为科学技术已经和人类生活密切相关。如果科学家特别是不能遵守人们期望他们遵守的科学规范，社会生活正常进行就会产生问题并处于危险之中。这在医学领域、工程技术领域显得特别突出，一个不负责任的小小失误可能会导致成千上万人的伤亡或者数十亿财产的损失。
5）当然，越轨也有它积极的社会功能，科学家的越轨行为对科学共同体并非总是有害的。科学家的越轨行为有助于科学共同体澄清并定义科学方法和科学精神。越轨行为是对规范的背叛，而规范本身是逐渐形成并完善的。许多社会规范在被破坏之前是模糊不清的，通过群体对越轨的反应进而澄清了规范。在科学家的规范行为中，科学方法和科学精神是通过科学家同行内部调节机制逐渐形成的，对荣誉和奖励的态度是通过社会机制逐渐完善的，越轨行为的产生表明这些机制存在缺陷。
4、越轨行为产生的原因
从科学心理学分析，科学家的越轨行为也可能源于个性特点、社会习得和挫折回应。特别可能产生越轨的个性是外向性格，这些人善于交际、容易冲动，他们渴望对社会生活中的丰富多彩做出回应，因此他们有尽快得到科学共同体承认的冲动。与外向性格相反的是内向性格，他们长于自我控制，他们会更加平静地对待自己在科学共同体中的地位。社会习得是指当一些科学家发现越轨行为可能带来好处而不受到惩罚时，他们很可能采取越轨行为。挫折回应是指个人的需要、冲动和欲望受到妨碍没有得到满足时，个人就受到了挫折，受到了挫折的人可能会采取一些极端的手段进行回应。比如，当一个年轻的科学家被认为论文发表数量不够职位得不到提升时，他可能会疯狂地炮制论文。
从科学社会学分析，没有科学家生来就是越轨者，而是社会环境通过多种方式造成了越轨者的越轨行为。在现代，科学的体制化、科学家角色职业化，使得追求真理不再是科学活动的惟一要求，功利性已开始成为科学活动的主要目的之一。由于科学内部的运行机制是通过奖励系统实现的，谋求独创性的成果，争取社会承认，自然会成为科学家行为内在的激励因素。一些科学家有了对社会承认的强烈渴望以后，就难以用严谨的科学态度来对待科学研究，走捷径成为一种选择。
科学活动提出了作为普遍欲求的目标（科学家成功的最重要标志是得到科学共同体的承认），同时也明确指出了实现这些目标的合法手段（如发表科学论文）或社会认可的手段（同行评议）。但是在科学快速变化和科学界的分层中不平等广泛存在的环境里，属于某些层次的科学家可能很难有机会通过合法的途径去实现成功目标。科层结构和不合理的制度限制了他们获得成功的机会。
例如，现行制度鼓励研究人员更多地发表论文，以便丰富他们的成就。当发表科学论文的数量而不是质量决定科学家的一切时（项目的申请、职位的升迁、同行的认可），就要求科学家多发表论文，致使科学家心理压力普遍较大，只能采取一系列手段追求论文发表数量，如化整为零、交费发表甚至伪造、剽窃。现代科学活动鼓励科学家对优先权、发明权的竞争，有时这种竞争被上升到组织行为甚至国家行为，因此会导致科学家为了抢时间把很多不成熟的实验结果发表。
又如，在同行评议过程中，普遍存在着被默顿称为马太效应的现象。马太效应是指“有名望的科学家的贡献被给予了过高的赞扬，相对不知名的科学家虽然做出了相近的科学贡献却只能得到低得多的承认。”马太效应的具体表现有：①把过去的成绩累计起来，形成一种优势，并影响以后的评价。②人们倾向于引证那些对所研究的问题或领域具有影响的工作，但同时也倾向于引证那些经常可见的科学家的工作。因此，容易引证的人被更多人引证，不容易引证得更不容易引证。③当一个人的杰出成绩得到承认后，人们可能会追溯并重新评价其早期工作。④承认和奖励的分配有利于那些名牌机构的科学家，而那些在声望较低、处于边缘地区的机构利的科学家则很难得到适当的承认。⑤，新的科学家需要逐步进入权威和名流集团之中，然后被承认。⑥科学界分层结构中流动是单向的，科学家只有升迁不可降格。
马太效应在很多情况下对科学发展具有不利的影响，使得很多具有才华的科学家被压制、埋没。当科学家体会到社会环境对他们的压抑，他们或者忍受着痛苦继续坚持不懈地努力，这种行为为社会所鼓励和赞扬；他们或者会失去对这些目标的兴趣，不再从事科学事业；或者失去通过合法途径达到成功目标的兴趣，转而产生用越轨的方法去获取成功的动机。如果科学组织对科学家的越轨冲动和诱惑未能加以充分的内在控制或外在控制，越轨行为就会产生。
科学竞争的加剧也是导致越轨的原因之一。进入现代科学以来，随着科学家人数的急剧增加和资源的相对稀缺，加大了科学共同体的竞争。过度的竞争有好处，也有害处。诺贝尔物理学奖得主鲁比亚充分肯定了科学竞争的好处：“科学竞争是必需的，绝对必需的。竞争是科学研究的动力，是科学家的骄傲所在，是很多科学活动存在的目的，是好科学壮大、坏科学衰败的自我调节机制。”而美国生物学家胡德则认为就业的激烈竞争加剧了科学的欺诈事件：“一旦你的博士后奖学金到期，在你开始计算被资助的年限之前，你必须找到一份好的工作或者能获得一份优厚的补助。现在，每个人都面临着巨大的压力，这在我们那个时候是不存在的。我获得学位之后就进入了博士后流动站，然后写了我的第一份基金申请。我用了两三天时间就完成了，而且根本没有考虑我会得不到它，我觉得那时自然而然的事。但现在，情况完全不同了。对大多数来说，写基金申请书是件需要两三个月才称完成的艰苦工作，而且可能还要来回修改三四次”。现在和胡德说的那个时候只不过相差30年，科学事业的变化之大让人惊奇＇5＇。
更为重要的是，科学和社会关系的日益紧密加剧了科研越轨。科学家从事科研的资金来源和课题来源趋于多样化，既有国家基金、非营利组织的基金，更有商业合同，这些东西把科学家和社会的其他组织捆绑在一起，对社会的其他组织依赖的增加也意味着社会其他组织对科学的干涉的增加。每一个组织都对科学家关于科研问题的选择、合作与竞争、交流、成果产出的质量和速度等都提出了不同的标准和要求，科学家不得不对这些标准和要求采取积极的应对措施。在这种情况下，“科学家即使过去曾经是一种自由自在的力量，现在却再也不是了。他现在几乎总是国家的、一家工业企业的、或者一所大学之类直接间接依赖国家或企业的办独立的拿薪金的雇员。由于他需要维持生计，因而科学家真正的自由实际上仅限于支付薪金的人所容许的活动。”＇6＇ 有的学者把这种科学称为“后学术科学（post…academic science）”，认为后学术科学的特点一是研究是计划