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一、我们从何而来？
现代科学产生之后，一直就有所谓的三大前沿问题：宇宙起源、基本粒子和人类起源，这基本上就是人类普遍关心而又却永远没有办法弄清楚的问题。在古代，除了基本粒子，另外二个问题都交给了宗教和神话去解决。达尔文的进化论发表之后，人类起源问题的解决似乎出现了转机，只是当时的社会精英很少认同他的观点。1860年6月30日，牛津大主教威尔伯福斯（Samuel Wilberforce， 1805～1873）气冲冲地在牛津大学图书馆发表演讲，他说，根据《圣经》的宗谱，人类是上帝在公元前4004年10月23日创造出来的。他这样讲是有根据的，出典是十七世纪的爱尔兰主教詹姆土·尤舍尔（James Ussher1581～1656）的研究《圣经》中的谱系成果。他还提出一个足以引起当时听众共鸣的问题，你能想象你自己是从猴子变来的吗？这场演讲大获成功。随着时间的流逝，人们如今记得的科学真理是达尔文的进化论，上帝创造人的说法也只是宗教史中的一项记载而已。
在今天大众的知识体系中，人类的起源的谱系树是由进化论者、考古学家从十九世纪开始绘制的。它由距今400～100万年的南方古猿发端，在距今300～200万年出现了与南猿有别，且能制造简单的工具早期猿人——能人（如理查德·利基发现的著名的非洲1470号人，他本人倒是认为能人另有渊源）。之后就是距今 100～20万年的直立人，如著名的北京猿人、爪哇猿人等。在地质年代的更新世中晚期或者说考古年代的旧石器中期，也就是在距今25～4万年的时期出现了早期智人，他们的特点就是能够制造精细的工具，尼人和我们熟悉的马坝人、丁村人都属于这一类智人。在十九世纪，人们开始认识到自身的进化与猿人有关就是由于早期智人的发现，它们不但在解剖学上与人类近似，而且似乎也有早期宗教行为，例如尼人用花卉为死者随葬。晚期智人（现代智人）承袭早期智人而来，所有的解剖学证据都显示了这一点，我们熟悉的距今4万年左右、在法国发现的克鲁马农人（Cro…Magnon）和在我国周口店发现稍晚的山顶洞人以及2003年在周口店发现的“田园洞人”、柳江人、资阳人等都是属于晚期智人。自二十世纪初期以来，这条按照解剖学规律大致完成的人类进化的证据链就牢牢地占据了各种教科书，构成了二十世纪人类由来的科学知识。
可是谁也没有料到，弗朗西斯·克里克（Francis Crick，1916～2004）和詹姆斯·沃森（James Watson，1928～）1953年在《自然》上发表了一篇基因双螺旋结构的 900字短文，引起人类学家和遗传学家转向用基因技术来解决人类本身的遗传学问题之后，这个链条就出现了裂痕。这其中就有斯坦福大学的教授卡瓦利—斯福扎（L．Cavalli…Sforza）的贡献。斯氏是意大利学者，二十世纪四十年代从事血液多态的研究，DNA结构破译后，他就利用统计学的方法研究人类基因的多态性问题，在1964年提出了人类遗传上的“吝啬原理”。它包括了二方面的内容：一是根据日本学者木村资生发现小量人群基因的“漂移”决定了人类基因的多态性，因此基因的进化是“中立”的研究成果，得出了基因突变与自然选择无关的结论；二是根据十四世纪出生于英格兰奥卡姆（Ockham）的圣方济各会修士威廉 （william of Occam，1285～1349）提出的宇宙哲学观，即所谓“如无必要，勿增实体”的“奥卡姆剃刀”（Occam′s Razor）原理，自然选择一定会走最简单的进化路线。在这个理论框架下，基因速率（基因随着时间有规律变化的频率）是由基因“漂移”决定的，人群关系越近，基因速率联系就越紧密。斯福扎据此画出了人类家族的谱系树，结果显示非洲人最靠近“树根”部，东亚人与他们分离的时间是在四万一千年，欧洲人与之分离则在三万三千年。韦尔斯把斯福扎的理论称之为人类学历史的二个里程碑！（第20页）
那么遗传学家凭什么认为人类起源于非洲而否认考古学上直立人多区起源论？其证据是什么呢？这就是基因武器，一个是线粒体DNA，一个就是Y染色体。
基因有复制重组的功能，在复制过程中又会产生无规则的“错误”造成多态性，使前代的基因图谱完全消失在无数次的基因重组过程中无法追寻。幸运的是细胞核之外还存在一种不能重组的线粒体基因。它原是细胞内的寄生虫，后成为细胞的“能量工厂”。在遗传中，子代的线粒体来自母亲，父系的线粒体在精卵结合时却不能进入卵细胞。所以父母双方线粒体的重组不能在子代中发生。在线粒体DNA的遗传中，突变往往带有发生先后顺序的信息。在线粒体基因的谱系树上，古老的突变只会出现在树的根基部位，晚近的突变就在树干的分枝上。因此，线粒体基因的这种母系遗传特性就成为追踪人群谱系变化的有效标记。另外，韦尔斯告诉我们，线粒体基因还有每100个会增加一个多态性的特点，这也方便了不同人种的区分。前面提到阿伦·威尔逊的研究，正是根据斯福扎开创的“吝啬原理”，利用线粒体基因的特性，确认最早的人类线粒体多样性是来自20万年前的非洲，而目前比较公认的准确证据是这位“线粒体夏娃”生活在15万年前（哈佛医学院的科学家今年在《科学》杂志上称，新发现线粒体的有重组现象，恐怕这个15万年的数据还有疑问），她是我们所有现代人的N代的曾祖母！
基因研究显示非洲人群有最大的多态性，它反映的事实就是非洲人比世界其他地方的人群都早。但是基因经过性别的反复重组，已不能用来追溯人类的迁徙历史。而在基因之外的线粒体也不能用来确定人类的迁徙。幸运的是，遗传学家在男性基因中发现了一个很重要的基因——Y染色体。它的作用就相当于显示女性谱系的线粒体DNA。我们知道人体细胞22对染色体中另有二条性染色体（sexchromosomes）X、Y，如是男性，性染色体就为XY；女性则是XX。遗传发生时，性染色体的配对并不遵守50：50混合规则，所以在遗传学家眼中，雄性是X染色体和Y染色体“错误”配对的结果。由于Y染色体只能以“XY”两条染色体配对的形式出现，在绝大部分区域不能和X重组，它就可以按照父系传递下去。换言之，在遗传中，母亲的X染色体可以传子，也可以传女，而Y染色体只能父子相传，这也就是斯福扎所称的“姓氏基因”。只要追寻Y染色体的多态性，人们就有可能找到Y染色体最早的图谱，如今这项工作又有了最新的结果。2000年 11月，包括作者韦尔斯本人在内的二十多位学者在《自然遗传学》上发表的结果让我们所有的人，特别是人类学家和考古学家们都大吃一惊，应用新的寻找Y染色体的技术，我们现代人的确起源于非洲，这位最早的男性祖先生活的时代距今只有五万九千年！在现代人的发展历史上，他显然是一位迟到的“亚当”。（第 44页）
二、亚当和夏娃的子孙
“奥萨马·本·拉登和W·布什有亲戚关系吗？如果你相信斯宾塞·韦尔斯在过去十年发现的遍布世界的基因证据，所有的人都出自一个6万年前的非洲祖先的话，就当然有！”这是一篇有关韦尔斯《出非洲记》的书评中的开头的话，听起来似乎有点耸人听闻，在我看到对该书的大量评论中，它最能代表现代基因遗传学的研究对人类进化多元起源论的彻底颠覆性。
自达尔文以来，世界各地大量发现的人类进化的化石一直是人类进化多元起源论的可靠依据。从我们国内古人类研究的专业书籍和教科书中来看，可以说几乎很少有人认同现代智人单线起源是合理的。吴汝康指出，从蓝田人、北京人、安徽和县人一直到马坝、资阳、柳江、山顶洞人等都保持有同样的现代蒙古人的若干特征。（吴汝康：《古人类学》丈物出版社1989年，第205～206页）稍晚出的古人类学的教科书中，虽然提到了威尔逊小组等的研究结果，基本上也是不予以采信。有人还说，先进种群的扩散导致落后种群（尼人）的绝灭不能成为单一起源说（“直立人非洲起源说”或“夏娃说”）的证据。（郭立新主编：《考古人类学》，广西民族出版社1998年，第155页）这叫什么逻辑？先进种群如果是出自非洲的晚期智人，他们扩散到世界各地难道不就是证明了现�