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六个沉思和六组反驳及答辩于１６４１年出版。
据笛卡尔自己说，这本书虽然是有关形而上学的，但他的全部物理学原理都包含在内。
１６４２年，笛卡尔开始用他未出版的《论世界》的内容写了一本哲学大全，献给被推翻了的波希米亚国王菲德利克的女儿伊丽莎白公主，于１６４４年用拉丁文出版，书名《哲学原理》，一部分是他自己翻译的，一部分是别人翻译由他审阅过的法文翻译本于１６４７年出版。
《哲学原理》本来打算包括六个部分：《知识原理》（即形而上学原理）
、《物理性的东西的原理》（即物理学原理）
、《天》、《地》、《植物和动
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笛卡尔生平及其主要著作５
物》、《人》，最后只写了前四个部分，后两个部分因缺乏材料没有写成。
笛卡尔在《哲学原理》里把人类全部知识比做一棵树，树根是形而上学，树干是物理学，树枝是分门别类的各种科学。因此他一反经院哲学的惯例，先讲形而上学。
１６４９年又出版了《论灵魂的激情》，献给伊丽莎白公主。
这是他最后的一部著作。
这时笛卡尔的哲学学说早已轰动一时，但终于因为与基督教会的宗教哲学不合而遭到禁止，他的书也被罗马教廷列为禁书。笛卡尔在荷兰定居达二十一年之久，一方面为了隐居，同时也是避难。他在荷兰曾迁居过二十四次，换过十三个城市，他的来往信件都由他在巴黎的好友麦尔赛纳转寄。布鲁诺的结局和伽利略晚年的遭遇吓坏了他，因为不但在科学方面他是天主教义的敌对者，即使是在哲学方面他也是教会御用的经院哲学的叛逆者。
由于瑞典女王克丽斯蒂娜（当时二十岁）三番五次的邀请，笛卡尔于１６４９年９月１日登舟去瑞典，得到克丽斯蒂娜的盛情款待；但由于要清晨很早上朝，违反了他清晨睡觉的习惯，而瑞典的冬天的气候又太冷，他着了凉，不幸病倒了，于１６５０年２月１１日死于肺炎，终年仅五十四岁。
译 者
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目 录
致神圣的巴黎神学院院长和圣师们………………………………１…
前言…………………………………………………………………８…
六个沉思的内容提要………………………………………………１…２第一个沉思 论可以引起怀疑的事物……………………………１…７第二个沉思 论人的精神的本性以及精神比物体更容易认识……………………………………………………２…６第三个沉思 论上帝及其存在……………………………………３…９第四个沉思 论真理和错误………………………………………６…２第五个沉思 论物质性东西的本质；再论上帝及其存在………７…５第六个沉思 论物质性东西的存在；论人的灵魂和肉体之间的实在区别………………………………………８…４反驳和答辩………………………………………………………１…０５第一组反驳 一个荷兰神学家作………………………………１…０５著者对第一组反驳的答辩………………………………………１…１７第二组反驳 由多方面神学家和哲学家口述，经尊敬的麦尔赛纳神父搜集的………………………………１…３７著者对第二组反驳的答辩………………………………………１…４６按几何学方式证明上帝的存在和人的精神与肉体之间的区别的理由…………………………………………１…７４第三组反驳 一个著名的英国哲学家作，和著者的答辩……１…８６第四组反驳 神学博士阿尔诺先生作…………………………２…１５
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２目 录
著者对神学圣师阿尔诺先生所做的对第四组反驳的答辩……………………………………………２…３９著者关于第五组反驳的声明……………………………………２…７６对六个沉思的第五组反驳 伽森狄先生作……………………２…７８著者对第五组反驳的答辩………………………………………３…７５笛卡尔先生致克莱尔色列先生的信作为对伽森狄先生第五组反驳的主要意见的再答辩…………………………４…１４第六组反驳 许多神学家和哲学家们作………………………４…２５著者对许多神学家、哲学家和几何学家作的第六组反驳的答辩………………………………………４…３５译后记……………………………………………………………４…５９
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致神圣的巴黎神学院院长和圣师们
先生们：鉴于我向你们提出这本书的动机是正当的，而且我深信，你们在了解到我写这本书的用意以后，也会有正当的理由把它置于你们的保护之下，因此，为了使它在某种程度上可以说是值得向你们推荐的书，我想最好是向你们简单地说明一下我是怎么打算的。
我一向认为，上帝和灵魂这两个问题是应该用哲学的理由而不应该用神学的理由去论证的主要问题。因为，尽管对于象我们这样的一些信教的人来说，光凭信仰就足以使我们相信有一个上帝，相信人的灵魂是不随肉体一起死亡的，可是对于什么宗教都不信，甚至什么道德都不信的人，如果不首先用自然的①理由来证明这两个东西，我们就肯定说服不了他们。特别是罪恶的行为经常比道德的行为在今生给人们带来的好处要多得多，这样一来，如果不是因为害怕上帝的惩罚和向往来世的报偿而在行为上有所克制的话，就很少有
①即不是神学的，而是人类理性的。——译者（以下凡圆码注，均为译者所加）
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２第一哲学沉思集
人愿意行善而不愿意作恶的。不错，我们一定要相信有一个上帝，因为《圣经》上是这样说的；同时我们一定要相信《圣经》，因为它是来自上帝的（这是因为：“信仰”是上帝的一种恩赐，上帝既然给了我们圣宠使我们相信别的东西，那么他同样也能给我们圣宠让我们相信他自己的存在）
，不过这个理由不能向不信教的人提出，因为他们会以为我们在这上面犯了逻辑学家们称之为循环论证的错误。
老实说，我已经看出，你们，以及所有神学家们，你们不仅肯定知道上帝的存在是能够用自然的理由来证明的，而且也肯定知道从《圣经》里推论出来的关于上帝的认识比人们关于许多造物①的认识要清楚得多，并且事实上这种认识是非常容易得到的；没有这种认识的人反倒是有罪的。就象《智慧篇》第十三章里所说的那样：“他们的无知是不可饶恕的，因为如果说他们关于世界上的事物深知到如此程度，那么他们从这些事物中怎么可能不更加容易地认出至上的主来呢？”在《达罗马人书》第一章里，说他们是“不可原谅的”
，并且在同章里用这样的话说：“关于上帝的认识，都明明白白地存在在他们的心里”。
这就好象告诉我们说，凡是可以用来知道上帝的，都可以用这样一些理由来指出，这些理由只要从我们自己的心里去找就够了，不必从别处去找，我们的精神就能够把这些理由提供给我们。就是因为这个原故，我才在这里提出用什么办法以及一定要采取什么方式才能做到认
①基督教用语，即“世界上的事物”
，因为基督教认为世界上的事物都是上帝所创造的。
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致神圣的巴黎神学院院长和圣师们３
识上帝比认识世界上的事物要更容易、更确切，我想我这样做不致于不合适吧。
①
至于灵魂，很多人认为不容易认识它的性质，有人甚至竟敢说，根据人类的各种理由，我们相信它是和肉体一起死亡的，只有信仰才告诉我们它不是这样。虽然如此，既然在利奥十世②主持下的拉特兰宗教会议第八次会上对他们进行了谴责，并且特别命令基督教哲学家们要对那些人的论点加以驳斥，要全力以赴地去阐明真理，因此我就敢于在这本书里执行这个任务。
此外，我知道很多没有信仰的人不愿相信有一个上帝，不愿相信人的灵魂有别于肉体，其主要理由在于他们说至今没有人能够对这两个问题做过证明。
我虽然不同意他们的意见，而且相反，我认为，那么多伟大人物关于这两个问题提出过的绝大部分理