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从进化论的分子基础看，基因突变是进化论的主要进化依据。然而，根据统计，百分之九十九以上的突变都是不正常的、有害的、有缺陷的，甚至是致命的。而且突变后的个体常常在自然环境中活不久，所以生物的突变只是少数，不是多数，突变是退化而不是进化。生物会有突变，然而不管如何突变，这些生物仍然是原来自己那一种属，不会变成高一等的其它种属生物。许多学者从基因突变发生的几率出发，计算出了产生新物种的概率，发现小得惊人。其中一个蛋白产生的几率是1/10的18次幂，至少需要 100亿年才能发生。这已经否定了进化论的基因突变基础。
近年来，随著分子生物学的深入发展，用生物分子的序列差异可以推算进化的时间，比较分子的差异程度，可以确定进化关系。但是科学家发现，研究不同分子的序列会得出不同的进化谱系。如果进化是事实，必然存在一个有序的演化过程，可是分子生物学的深入研究却表明不存在这样的进化体系，完全是混乱的关系，那么进化怎么可能存在呢？
三、生物物种的灾变说证据
在漫长的宇宙历史中，地球遇到洪水、海啸、地震、火山爆发、冰川、外来天体的撞击、地壳变动而导致生物物种的灭绝是有可能的。太阳系内有大约14亿颗彗星，还有闯入太阳系的小行星。目前科学界的共识是，只要地外撞击体的直径处于0。6千米～5。0千米之间，就有可能使全球陷于“撞击冬天”的困境，长达数月甚至数年的黑暗而寒冷的冬天将笼罩全球，导致颗粒无收，生态系统破坏，全球性的饥荒，直接撞击造成的生物灭绝，臭氧层的破坏，酸雨的出现，植物的中毒，人类将处于灭绝的边缘。美国地 质调查局的天文学家休梅克估计，在目前的近地空间，直径为10米左右的近地小行星和近地慧核约有20万颗，这些小天体平均每1000年与地球撞击一次；直径大于1千米的近地小行星和近地慧核数目高达2000颗，平均每10万年和地球撞击一次。美国加州大学洛山矶分校的地质学家弗兰克。凯特在98年11月18日的《Nature》杂志上撰文指出，他已经在墨西哥尤卡坦半岛上的奇克苏卢布郧坑中，找到了一块埋在白垩纪结束、第三纪开始时（第三纪与恐龙灭绝的时间大体一致）的地层中的郧星碎片化石，此化石中含有外星物质铬，被认为是6500万年前郧星撞击地球的证据。据科学家们计算，当时一颗郧星坠落在墨西哥尤卡坦半岛上，巨大的撞击导致爆炸，并把郧星向西抛出去5400英里，落在太平洋中部的洋底，由此导致恐龙的灭绝。
此外地壳大变动也可能是大灾变的原因。比如，九十年代初，澳大利亚的一些科学家在离南极二百英里的地方发现了山毛榉。他们测定有两百到三百万年历史。按现在地质学的假设，把南极这块大陆移动到能长山毛榉的地方要五六千万年，而发现的这个证据只有二三百万年的历史。所以唯一的解释是：由于地壳大变动，南极大陆在不到两百万年的时间里移动到了温带。
在整个北半球的无人区、西伯利亚北部、阿拉斯加，考古学家们发现了成千上万的哺乳动物的冰冻遗骸，主要是猛犸象，也有犀牛和其他种类的生物。还发现了和这些遗骸在一起的石造手工艺品。遗骸有的保存得很完整，有的被扯碎和树枝绞在一起。检验它们的胃里食物，发现还有没来得及消化的气候更温和地区的草原植物，这些植物在今天的西伯利亚北部是不可能生长的。对这一神秘现象的唯一解释就是整个地壳曾发生过大的位移，它们所在的土地被突然推到一个冷得多的气候条件下。以上证据动摇了达尔文的生物进化论，生物可能就是这样经过产生、发展到毁灭一个个周期循环的。
四、月球是人造天体
月球的天文参数证明月球不是自然天体。月球的直径为地球直径的27％，而其它行星的天然卫星，直径一般都不会超过母星的5％。月球不是绕地球旋转，而是伴著地球对转。其反常轴向自旋速度非常之快，远远快于大小、距离与其类似的行星的卫星所应有的速度。一般天然卫星的轨道都是椭圆的，而月球轨道却是园形的，和人造地球卫星的圆轨道类似。如果月球是一颗宇宙中的天然星体，那么它一进入太阳系就会被个大无比的木星吸引过去而不会跑到地球身边。所以，很难想象月球是在宇宙中自然形成的。
美国科学家和宇航员进行的月震实验显示，震波只是从震中向月球表层四周传播，而没有向月球内部传播，就象在一个完全中空的金属球体上发生的。科学家冯。布劳恩博士指出，振动在月球内部的传导速度与振动在金属中的传导速度一致，因而月球内部可能存在金属的壳体，而在壳体之上覆盖著松散的10～20英里厚的石块层。科学研究表明，实心的宇宙天体由于内部的液态外核的流动产生感应电流从而会形成磁场，而月球几乎不存在磁场。月球岩石的平均密度是3。33克/立方厘米，地球岩石的密度是5。5克/立方厘米，按照月球的体积计算，如果月球是实心的话，月球的重力应该比现在实测的要大的多。而现在月球的重力很小，唯一的可能就是月球不是实心的。月岩研究表明，月球表面最古老的岩石形成于46亿年前（有的岩石寿命达70亿年），而我们地球上发现最早的岩石的形成时间不过是39亿年。并有6种元素是地球上所没有的。可见，月球是人造天体已经被现代科学说证实。
五、另外时空的理论和证据
另外的空间，人的肉眼看不见。但看不见的事物并不一定不存在。人肉眼看到的形像不过是对可见光的感知，而可见光在电磁波大家族中仅仅只是一个极窄的波段，很多天体发出的不是可见光。对于另外空间的存在，科学家早已从不同角度在进行研究、探讨，并认为是完全可能的。例如，一些量子物理学家通过研究提出存在著与我们人类所存在的空间平行存在的“平行世界”。现实世界并不是由一个宇宙构成，但是我们只能在它的一个层面上活动。70年代提出的“超弦理论”则从数学上论证宇宙应是多维 空间，如10维或11维空间或26维，甚至有人认为宇宙是无穷维空间。另外近十余年来，宇宙大爆炸理论、暴胀宇宙论和宇宙弦理论也认识到了另外时空。例如，根据混沌暴胀宇宙模型指出，极早期宇宙中存在著若干个空间畴，每一个空间畴将作指数膨胀，形成大小超过可观测宇宙的微宇宙泡。每一个微宇宙泡可以演化为一个对应的宇宙，而我们生活的这个宇宙只是由其中一个微宇宙泡暴胀演化而来的。
我们人感觉、接触到的基本上是分子构成的宏观物体，所在的是位于分子和星球之间的空间。事实上，现代弦理论的T对偶性理论认为，如果宇宙缩小到小于普朗克长度（10…35米），宇宙将转变为一个对偶的宇宙，随著原先宇宙的缩小而不断增大，看起来象大尺度一样。因此电子到原子核之间和分子到星球之间一样，也是一个极其广阔的空间。
人们不仅从理论上认识到了另外空间，而且还有关于另外时空的案例记载。比如美国东南海域百慕大三角海区，因频繁发生飞机船只失踪事件而闻名于世。1970年一架从美国飞机飞越百慕大上空时突然从雷达荧光屏上消失了10分钟，与地面失去联系。飞机著陆后发现飞机上及所有乘客的钟表都慢了10分钟。这些现象用另外时空理论不难解释：这是人或物体进入了另外时空，而在另外的时空，时间场相对人类这个空间可能过得很慢，在这个空间里的几十年在那个时间场中可能只是几秒。
六、物质精神一性的证据
1966年美国测谎仪专家克里夫。巴克斯特（CleveBackster）把测谎仪的两个电极连接到一株牛舌兰的叶子上，他发现，往牛舌兰的根部浇水后，测谎仪电流计的波形记录仪的记录笔画出了类似人在高兴时的感情冲动的曲线。当他心想用火烧一下牛舌兰的叶子是什么反应，还没等他行动，记录笔瞬间画出了类似人在恐惧时的曲线。后来巴克斯特和他的同事们对25种不同的植物，包括莴苣、葱、橘子、香蕉等，进行了类似试验，所得的结果相同。巴克斯特还对人体的体细胞进行了实验研究。发现人的体细胞不仅会随人的感情变化做出反应，而且在离开主