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本制度统一规定会计科目的编号，以利于编制会计凭证，登记账簿，查阅账目，实现会计电算化。科学事业单位不得随意改变或打乱重编。在某些会计科目之间留有空号，供增设会计科目之用。
对于主管部门或代行拨款职能的科学事业单位收到财政拨付的应返还所属单位的预算外资金，应通过“其他应付款”科目核算。
支出及成本费用类科目中的成本费用科目和“待摊费用”、“预提费用”科目一般适用于实行内部成本费用核算的科学事业单位。
其他货币资金业务较多的科学事业单位可增设“103其他货币资金”科目。
设备、材料采购业务较大的科学事业单位，要增设“111预付购货款”科目。
定型批量生产产品或其他工程承包等业务较多的科学事业单位，可以增设“ 112包装物”、“114自制半成品”、“118产成品”、“416产品销售收入”、“417工程承包收入”、“ 531产品销售成本”、“532工程承包成本”、“537销售费用”等科目。
采用分期收款销售商品的科学事业单位，可增设“128份期收款发出商品”科目。
委托外单位加工业务较多的科学事业单位，可增设“113委托加工材料”科目。
低值易耗品数量较多或采用分次（分期）摊销法分摊低值易耗品成本的科学事业单位，可增设“129低值易耗品”科目。
有商品购销业务的科学事业单位可增设“125库存商品”、“126商品进销差价”、“418商品销售收入”、“534商品销售成本”等科目。
固定资产改良或大修理业务较多的可增设“121在建工程”科目。
科学事业单位如发生被冻结存款等业务时，可增设“143其它资产”科目。
科学事业单位如有一年以上的待摊费用等业务时，可增设“142递延资产”科目。
科学事业单位经营收入中某项业务数额较大的可将二级科目改为一级科目设置和使用。
在填制会计凭证、登记账簿时，应填制会计科目的名称，或者同时填列会计科目编号和名称，不应只填科目编号而不填科目名称。
第二十七条 科学事业单位会计科目使用说明（见附件二）。
第六章 会计报表
第二十八条 科学事业单位会计报表的具体格式和编制说明，由本制度规定（见附件三）。
科学事业单位应按期向有关部门报送会计报表。会计月报表应于月末终了后七天内报出；季度报表应于季度终了后十五日内报出；年度会计报表应于年度终了后三十天内报出。法律、法规另有规定者，从其规定。
会计报表的填列以人民币“元”为金额单位，“元”以下填至“分”。
会计报表应依资编定页数，加具封面，装订成册，加盖公章。封面上应注明：科学事业单位名称、主管部门、地址、报表所属年度、季度、月份、送出日期等，并由单位领导、会计主管名或盖章。
科学事业单位的主管部门或单位，应当根据同级财政部门的要求，在认真审核所属科学事业单位会计报表的基础上，编制汇总会计报表。
第七章 附则
第二十九条 经有关部门批准，办理完各项划转手续，已进入企业（企业集团）、纳入企业财务管理体系的单位，应执行同行业或接近行业企业会计制度。
非国有科学事业单位可参照本制度执行。
第三十条 本制度由财政部和国家科委负责解释、补充和修订。
第三十一条 本制度自1998年1月1日起执行。国家科委、财政部1987年发布的《科学研究单位会计制度》（试行）（〔1987〕国科发条字0258号）同时废止。
附件一：科学事业单位会计科目表
科学事业单位会计科目表
序号编号 科目名称序号编号 科目名称
一、资产类33308事业结余分配
1101现金34309经营结余分配
2102银行存款四、收入类
3105应收票据35401财政补助收入
4106应收帐款36403上级补助收入
5108预付合同款37404拨入专款
6110其他应收款 38405科研收入
7115库存材料 39406技术收入
8116科技产品40407试制产品收入
9117对外投资41408学术活动收入
10120固定资产42409科普活动收入
11124无形资产43410预算外资金收入
12130待摊费用44412附属单位缴款
13140待处理财产损益45413其他收入
二、负债类46414经营收入
14201借入款项五、支出及成本费用类
15202应付票据47501拨款经费
16203应付帐款48502拨出专款
17204合同预收款49503专款支出
18207其他应付款50504事业支出
19208应缴预算款51505经营支出
20209应缴财政专户款52516上缴上级支出
21210应交税金及附加53517对附属单位补助
22211应付工资54519所得税
23212应付社会保障金55520结转自筹基建
24231预提费用56521科研成本
25261长期应付款57522技术成本
三、净资产类58523试制成本
26301事业基金59523学术成本
27302固定基金60525科普成本
28303专用基金61526经营成本
29304财政补助结存62529研究室（车间）费用
30305拨入专款结存63535管理费用
31306事业结余64536财务费用
32307经营结余65539税金及附加
附件二：科学事业单位会计科目使用说明
第101号科目 现金
一、本科目核算科学事业单位的库存现金。
二、科学事业单位收到现金时，借记本科目，贷记有关科目；支出现金时，借记有关科目，贷记本科目。
三、本科目为借方余额，反映单位库存现金的数额。
四、有外币现金的科学事业单位，应分别按人民币及各种外币设置“现金日记账”进行明细核算。
第102号科目 银行存款
一、本科目核算科学事业单位存入银行和其他金融机构的各种款项。
二、科学事业单位将款项存入银行或其他金融机构时，借记本科目，贷记有关科目；提取和支出存款时，借记有关科目，贷记本科目。
三、本科目为借方余额，反映单位存在银行或其他金融机构各种款项的余额。
四、有外币存款的科学事业单位，应在本科目下分别按人民币和各种外币设置“银行存款日记账”进行明细核算。
五、本科目应按银行存款的不同种类及银行账号设置“银行存款日记账”进行明细核算。
第105号科目 应收票据
一、本科目核算科学事业单位因销售或转让商品、产成品及科技产品等收到的银行承兑汇票。
二、科学事业单位收到应收票据时，借记本科目，贷记“试制产品收入”、“经营收入”、“应收账款”等有关科目。
三、应收票据到期收回，按实际收到款项借记“银行存款”科目，按票面金额，贷记本科目，按实收票据利息，贷记“其他收入”科目。
四、科学事业单位待未到期的应收票据向银行贴现，当实际收到款项小于票面金额时，借记“银行存款”、“经营支出”、“事业支出”或“财务费用”等科目，贷记本科目；当实际收到款项大于票面金额时，借记“银行存款”，贷记本科目，贷记“其他收入”科目。
五、本科目为借方余额，反映单位持有的未到期的应收票据余额。
六、本科目应按应收票据的种类和单位设置明细账，并应设置“应收票据备查簿”详细登记每一笔应收票据的基本情况。
第106号科目 应收账款
一、本科目核算科学事业单位因销售科技产品、商品、提供技术转让、进行技术性服务或学术、科普活动等业务，应向购货、受让单位收取的款项。
二、发生应收款项时，借记本科目，贷记“试制产品收入”、“经营收入等”有关收入科目。
收到款项时，借记“银行存款”等科目，贷记本科目。
三、确认为无法收回的应收款项，经规定程序批准核销时，借记“事业支出”、“经营支出”或“管理费用”等科目，贷记本科目。
四、本科目为借方余额，反映单位已确认收入，应向购货单位或受让单位收取的账款余额。
五、本科目应按债务单位或个人设置明细账。
第108号科目 预付合同款
一、本科目核算科学事业单位委托其他单位承担科技开发项目或课题、组织学术、科普活动等任务，按照合同规定预付给承担任务单位的合同款项。
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