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人类光是遗传性疾病就不下4000种，每种遗传性疾病都是受一个或数个致病基因控制的。基因治疗是治疗遗传性疾病最有效的手段，甚至是唯一的根治手段。然而，这4000多种遗传性疾病中，已找到致病基因的还不到3％。
一旦人类基因组计划实现，这4000多种遗传性疾病的致病基因就将暴露在光天化日之下，进行基因治疗就有了保证。
再拿人们视作洪水猛兽一般的癌症来说吧。至今已在人的DNA里发现了近百种癌基因，这些癌基因长时期处于静息状态，一旦有某种条件使它活化，它就会使细胞无节制地分裂，人就会生癌。实施人类基因组计划后，所有的癌基因都将一一亮相，给治疗带来许多线索——或者是进行基因手术，或者是控制它的活化条件，等等。这就等于为人类攻克癌症堡垒提供了一份精确的军用地图。
更有趣的是，人类基因组计划实现后，每个人在胎儿阶段就能作出基因组分析，建立起个人的基因档案。这份档案里不仅记载着致病基因，还记载着体质、性格、语言、智力等多方面的遗传特点。人们可以根据这份档案来预防疾病，确定最适宜于自己的生活方式、饮食规律以及事业上的发展方向，大大提高生命的质量。这部“基因辞典”将是人类全面细致地认识自身的“金钥匙”。它的问世，将使人类在人体科学中大大地前进一步。可以毫不夸张地说，它将使人体科学研究出现一次新的飞跃，它将极大地促进人体生理学、病理学、遗传学以至人类考古学及与此相关联的各种边缘学科的迅速发展。
基因工程的应用
基因工程的产生使整个生物技术跨入了一个崭新的发展时代，传统的生物技术与基因工程的结合形成了真正有生命力的现代生物技术。
运用传统的生物技术方式要用10万只羊的下丘脑才能获得1毫克生长激素抑制素，所耗资金相当于通过人造卫星从月亮上搬1公斤石头回地球；现在通过基因工程，将人工合成的人生长激素抑制素基因重组一个高效表达载体在大肠杆菌中表达，只需要10升这种重组的大肠杆菌培养液经计算机严格控制条件就可以获得。这就是现代发酵工程的威力。
1989年，美国将获得抗体的重链基因和轻链基因构建成重组DNA，转入烟草细胞，利用植物细胞组织培养技术培养出转基因烟草，结果在烟草叶片上产生了点叶蛋白总量的1。3％的抗体。按照这种水平计算，美国只需要用其目前种烟草土地面积的1％来种这种转基因烟草，每年就可以生产出270公斤的抗体，足够27万病人用1年。这是基因工程与细胞工程结合后产生巨大社会效益和经济效益的一个明证。
现在的遗传育种基因工程技术把一些有用的优良或特殊性状的基因转入到农作物中，缩短育种时间达几万倍。目前已经培育出了抗病毒、抗除草剂、抗虫、高蛋白的各种农作物品种，也培养出了携带人的生长激素基因的猪种和鱼种，它们都比普通猪和鱼要长得快，长得大。
现代酶工程在基因工程技术的帮助下已对各种酶进行大量改造。例如将水解霉素的青霉素酰化酶基因重组到一个质粒上然后构建一个新的菌株，结果使新构建的菌株的酶活力提高50倍，等等。诸如此类的例子不胜枚举。
我国的基因工程研究及应用虽起步较晚，但已获得了较大的发展，取得了一定的成果，据不完全统计，已经研制成功和正在研制的基因工程产品就有几十种，有些已经投产并开始使用，如基因工程α—干扰素，基因工程乙型肝炎疫苗等等。总之，基因工程给传统生物技术带来了彻底的革新，而且应用范围仍然在不断加深扩展，前景十分广阔。
生物工程新星——蛋白质工程
现代的酶工程将奶酪也列为生产对象。然而，困难出现了。生产奶酪时用来杀菌的T4溶菌酶，在工作环境温度67℃下，3小时后活力仅剩下0。2％，这样就无法维持正常生产。
这个问题留给蛋白质工程来解决。
高新技术的日新月异实在令人赞叹不已。生物工程至今还常常被人用“方兴未艾”这个词来形容，却已经有了崭新的一代。基因工程、细胞工程、发酵工程、酶工程这四大支柱已经被归入“上一代”、“老一代”了。
又如，人们寄托了很大希望的抗肿瘤、抗病毒药物干扰素，遇热也极易变性，在…70℃的低温条件下也只能保存很短的时间。问题之二是产品的副作用。例如，用小鼠细胞培养、生产的单克隆抗体，进入人体后一方面表现出强大的药理作用，一方面却会引起免疫反应，因为它毕竟是异体蛋白。此外，生物工程的许多产品还存在着活性低、提纯困难等问题，这些问题正是蛋白质工程的攻关对象。
要改造一种蛋白质，大致要经过这么几个阶段：1。通过计算机图像分析，找出蛋白质整体结构中足以引起某个性能发生改变的关键部位，或者说在氨基酸长链中找到那个关键的氨基酸。然后确定这个氨基酸需要如何加工修饰，或者干脆用哪一个氨基酸来代换。
2。找到生物细胞中指导合成这种蛋白质的DNA片段，并找出与那个关键氨基酸相对应的碱基，经过分析后用另一个碱基来取代它。这个繁琐的过程也少不了计算机的帮助。
3。将改造过的DNA片段移植到细菌、酵母菌或其他微生物体内，经过培养，筛选出能“分泌”出理想的新蛋白质的菌株，再运用发酵工程大量生产这种新蛋白质。
以上说的仅仅是蛋白质工程一种比较有代表性的生产过程，对这个过程的描述也是极其粗略的。然而，它大概已经能表明，蛋白质工程集中了生物工程的精粹，而且还是计算机技术和现代生物技术杂交生成的宠儿。
拿计算机图像显示来说，它显示的不光是氨基酸排列顺序，不光是氨基酸长链如何缠绕、盘旋的立体结构，还要显示出每个氨基酸的受力情况——在哪些相邻分子的引力下处于平衡状态。更进一步地，它还要显示如果某个氨基酸发生改变，这一平衡状态将会如何变化，对整个蛋白质的功能将会有什么样的影响。如果没有现代计算机技术，这一切都是难以想象的。
蛋白质工程问世还不久，取得的成果已经令人刮目相看：那种T4溶菌酶，蛋白质工程施以回春妙手，将它的3位异亮氨酸换成半胱氨酸，再跟97位半胱氨酸联接起来。这样，它在67℃下反应3小时后，活性丝毫未减。
在…70℃的低温下难以保存的干扰素，经蛋白质工程的点化，两个半胱氨酸被换成丝氨酸，一下子变得可以保存半年之久了。
一种生产中很有用的酪氨酸转移核糖核酸酶，只是在一个位点上用脯氨酸取代了苏氨酸，催化能力一下子提高了25倍。
对于用小鼠细胞培养生产的单克隆抗体，专家们已经提出了“开刀方案”，打算把它整修得更接近于人的抗体，以减轻副作用。
蛋白质工程不仅要对那些生物工程的产品进行再加工，还要对一些纯天然的蛋白质进行模拟和改造。
例如，那绵软、飘逸的蚕丝，那蓬松、暖和的羊毛，那纤细、坚韧的蛛丝，它们本质上都是蛋白质。对它们进行模拟和改造，再实现大量生产，将会获得性能比蚕丝、羊毛、蛛丝更优异的材料，改善我们的生活条件。
浏览一下对蛋白质工程的众多评价是很有意思的。
有人称它是第二代生物工程，有人称它是第二代基因工程。
有人说它“曙光初露”，有人说“前途无量”。
80年代，有人将“21世纪是生物学的世纪”这句话改成“21世纪是生物工程的世纪”；90年代，又有人提出，“21世纪是蛋白质工程的世纪”。
人们的关注和瞩目才会引出众多的评价。众多评价至少传递出一条信息：蛋白质工程充满魅力，充满希望。在近几年内，蛋白质工程可能会取得更多的突破，又将会招来许多新的评价，我们期待着。
设计新的生物物种可能吗
利用基因工程和蛋白质工程技术，人类不仅已经可以在分子水平上以微生物、植物、动物本身等不同种属之间的基因进行随意的剪切拼接，而且来源不同的微生物、植物、动物和人类之间的基因也可以任意地重组传递，甚至还可以按照自己的意愿设计合成新的蛋白质。
从技术上讲，