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宗之学，其立义就在于世俗谛上。唯识学是转依之学，它有能对治的作用，欧阳竟无大师曾云“唯识学诠用义为一大要旨”，就是此义。
4、种子与真如。唯识学的真如是一切法的理体，是不生不灭的大道，它是一切法的依因，而不是生因。一切法之生起皆由自体种子所生，种子是有为法，真如是无为法。在法相学中，种子就是因缘，它是一切法生起的根本原因，所以称为种子，这个种子是现象论的原因。在唯识学中，种子是被人为规定了的符号信息，它是观念论中的存在，并不是一个实体性的存在物，所以称为名言种子。心识与种子都是有为法，但它们都有其法尔的真实性，这就是其理体，也即真如，《成唯识论》云“此诸法胜义，亦即是真如，常如其性故，是唯识实性”。真如是体（是依之体，不是生之体），种子是用（是依体而生用，不是从体起用），真如是所，种子是能。真如之理须无漏种子生起现行智时可照见，无漏种子依附于第八识体，但不是第八识所藏，这是因为无漏种子（功能）是八识自体的法尔之性德。世间学人不知唯识学立论的善巧处，妄批种子论，斥为多元论，斥阿赖耶识为灵魂论，这都是倒见。唯识学是彻底的缘起论，它是承认一切法无自性的，所以多元实体论、灵魂神我论都与唯识学不同，倘若说唯识学是什么论的话，那就是究竟无我论。真如是无我之理，种子是因果变化之事相，理与事相关，理与事绝对不是一个东西，这就是唯识学的真如观。
5、唯识学建立“种子论”的理论意义。呈现在我人面前的世界，是多样性和变化性的世界。为了在观念界把这个世界因果关系阐明，唯识学建立了符合自身理论旨趣的种子论。人是通过心识功能来认识世界和自我的，心识的有意活动，就是一种模拟过程，在某种意义上讲，唯识学就是内心模拟思维学，种子是内心虚拟世界的单元。唯识学认为，转识成智首先要对心识内在功能进行如理认识和向智化方面转移。唯识学是了别学，是对符号性世界的认识学。不知道唯识学的特殊性，就无法真正得到唯识学的底蕴。唯识学为了说明认识的发生，当然认识与存在是同一规律，对认识的认识就等于对存在的认识。认识就是世界，世界就是认识，在方法论上，不建立种子论，就无法描述认识存在之过程。中观学讲发生论只在因缘无性上讲。真常学讲发生论，全在于一心真如之体上讲。唯识学与它们都有不同，唯识学认为中观学式的因缘论可以把现象实理讲出，但无从说明认识的逻辑关系，种子论的提出就是要克服中观学在认识论上的不足，真常学之发生论是一种一体多用论，在唯识学看来，这违反因果规律，至少在世俗谛上是这样的。为了说明什么因得什么果，或者说什么果必有什么因，所以唯识学才建立种子论。在佛教中，只有唯识学的认识论、方法论、实践论是完整的、有效的，所以玄奘法师才极尽全力弘扬阐发唯识妙理。我人不能离开思想进行思想，我人不能离开逻辑来理解事物，唯识学的种子论就是构成我人的思想逻辑的基本要素。学习唯识学种子论是彻悟唯识奥蕴的玄机。种子论的理论意义在于为唯识学的内在认识论提供了坚固的基石，唯识学把世界的原理，纳入种子的范畴中进行研究与揭示。在某种意义上讲，唯识学就是研究种子与现行之原理。