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与竺可桢会面的当天夜间，蒋百里因心脏病突然去世。第二天，竺可桢得知他的死讯，感叹到：“我听后仿佛晴天霹雳，昨天谈话时还精神矍铄，我还自叹不如，真是悲惨啊！”
11月19日，天刚放亮的时候，竺可桢便来到蒋百里的灵堂。追悼会持续了一个小时，而后在仪仗队和军乐队的伴随下，送殡队伍浩浩荡荡，穿过宜山城，出南门后，将蒋百里的灵柩安葬于宜山城外的南山。
此时，尽管武汉已经沦陷，但是千里之外的宜山，除了偶尔的防空警报声之外，还算是一个安全的地方。这一学年国立浙江大学共招生471人，占全国大学录取新生总数的12，生源大部分来自它流亡时经过的省份：浙江、江西和广西。流亡了一年的国立浙江大学暂时有了一个栖息之地，但疾病却不期而至。
广西的宜山开始同泰和就不同了，比较起来，所谓瘴气多了，瘴气实际上就是，他四周是山嘛，所以山里边同我们这里雾大的时候一样，有的这种云的样子，那么这个瘴气为什么叫瘴气，就是当地历史上边下来嘛，老百姓都是叫它瘴气，瘴气的坏处就是要生病。
当地宜山人吃岩盐，而学生们原来都是吃海盐的，海盐里面有碘，这个岩盐里面没有碘，缺碘的人得大脖子病。高年级的同学对这件事没有什么太大反应，低年级的学生就不同了，有一个一年级的同学从广东来的新生，看到有的同学大脖子吓得就走了，退学了，不上了，不敢在这里。
为了预防缺碘而引起的甲状腺肿大，即大脖子病，江浙一带的学生纷纷写信给家人，要求邮寄紫菜。
紫菜里有碘，含碘较多，而且紫菜又轻，装在信封里面就可以寄得来，随便哪一家拿到了紫菜，就交给这个饭师傅，就熬汤，每一桌一碗汤，大家吃。
但最危险的疾病并非大脖子病，而是恶性疟疾。参加完蒋百里葬礼后的竺可桢，回到宜山城内的办公室，准备召开校务会议，这时候他得知了一个令人担忧的消息：任职于江汉工程局，此时也在宜山的侄子竺士楷患上了疟疾。
广西宜山这些地方按古人讲，叫作蛮瘴之地，宜山宜水不宜人。主要是指它疟疾横行。那么浙大到了这个地方，也是在劫难逃。学生染病，家属染病，数十人，并且发生了死人事件。
疟疾是由疟原虫引起的寄生虫病，夏秋季发病较多，严重型的疟疾极易致人死亡。在热带亚热带地区，疟疾一年四季都可能发生，很容易流行。宜山旧称“蛮烟瘴雨”之乡，属于亚热带气候，这里温暖多雨。多雨的环境极易滋生蚊子，而蚊子则是传播疟疾的祸首。除气候条件外，战时增加的人口也成为疟疾迅速传播的一个原因。
那时候，从湖北撤下来的十多万伤兵中，有两万多疏散到广西宜山一带。随后，广州的沦陷也迫使广州黄埔军官学校向桂北搬迁，黄埔军校第四分校奉令搬迁到宜山，这使得宜山人口激增，一时间燃料、房屋、食品，特别是药品的供应骤然紧张。
1938年10月17日，是浙江大学师生对疟疾这种疾病，开始感到恐惧的日子。下午四点，浙江大学文理学院副院长张绍忠向竺可桢报告，其侄女因患疟疾病逝。在随后的两个月中，浙江大学里患疟疾的人数从10多个增加到146人，其中恶性患者占77，到1939年1月，又增加了200多人，几乎每家都有患病之人。电机系学生袁可志不幸也染上了恶性的疟疾，不是一般的疟疾，一阵冷一阵热的，是高烧不退的疟疾，恶性疟疾很容易死人。
当时治疗疟疾的特效药是扑虐母星和阿的平，浙大离开杭州时所带的这两种药物早已用完，离宜山最近的柳州和桂林却买不到医治疟疾的药物。疾病在蔓延，但药物匮乏，这让师生们惶恐不安。为了解决疟疾的传播，竺可桢对宜山当地的蚊子进行研究，以便确定师生所患的是哪种类型的疟疾，同时派人到梧州和已经沦陷的广州购药。
过了一段时间以后呢，学校以及学生们自己通过各种渠道，总算是搞到了一点药，但是也解决不了那么多患者，主要还是靠自身的抗体，和能够提供的一些，尽量好的这个休养的条件，来渡过这个难关。
随着冬季的到来，传播疟疾的蚊子逐渐减少，到1939年1月底，一度造成全校恐慌的疟疾开始得到控制。就在师生们为疟疾得到控制而高兴的时候，又一场灾难已经悄然而至。
日军占领武汉三镇和广州后，开始对桂林、南宁、贵阳等重要城市进行经常性轰炸。小小的宜山城上空，经常可以看到呼啸而过的日本轰炸机。一旦发现日机，宜山城里便会摇响警报。
专门有一个人，手拿手摇的报警器，一摇了后会嗡嗡响的，这个警报声传的地方不远，你一个地方听得到，另外一个地方听不到，你整个宜山城包括外面听不到，听不到。所以就挂灯笼在这个山上。
挂一个灯笼是预备警报，挂两个灯笼紧急警报，就这样子就告诉你们快点逃。
为避免给日军提供轰炸目标，宜山当地政府还做了特殊的规定。
一个规定是不能戴眼镜子，眼镜子是反光的。一个不许带电筒，还有呢，不许穿白衣服，或者接近白的淡的衣服。
1939年2月5日，农历立春，宜山天气晴朗。南国的立春此时早已显露出丝丝春意，国立浙江大学的学生们觉得，这是一个不错的星期天，许多同学组织郊游野餐会，宜山的农民不断地看到浙大学生来到城外的小龙江边，或者附近的山丘上，野餐、合唱。上午，竺可桢和教务长胡刚复带着几个师生，前往宜山城南10公里的太平乡看望从广东逃难来的二百多名儿童。临近中午时分，宜山的防空警报摇响了。
那一天正好是中午的时候，学生们正在食堂里面，就是原来的标营，食堂在标营，正在吃饭，吃饭时忽然听见警报了，大家把筷子啪一下放在桌子上就往外跑。
因为2月4号听到广播是贵阳炸了嘛，所以那一天2月5号的话，大家都有警惕性的。
学生们跑得快就跑到小龙江岸上躲起来了。那个炸弹下来，有嘘尖叫声的，所以那个时候呢，马上要卧倒啊，还来得及的，卧倒以后炸弹炸起来啊，炸不到你的身上。
这个炸弹落在学生们的旁边，炸弹炸在泥地上面，泥土像树这样一把起来，资源和许多泥土盖在我身上，但是学生们并没有受伤。
龙江边有许多天然的岩洞，这些岩洞成为浙大师生躲避轰炸的天然防空洞。
据回忆，我跟那个同学我说，我们躲在那个洞里面去吧，跑到里头去呢，那个洞并不大。我们进去了以后呢，看到里面有一条蛇，差不多比我们一个人两个手臂伸出来还要长一点，它在那里看着我们。那么我们两个人也看着它，它大概看我们有两个人，它也不敢来惹我们，我们也怕它，也不敢去惹它。然后等到轰完了以后呢，我们出来，我们也走了，相安无事，它还在里头。
据回忆，到时候跑得太快了，这个洞都找不到了，所以就沿着这个路上走，走到我不是讲有一个坟地吗，那坟地上面碑石，那东边照过来有个影子，我们就两个人穿着旗袍，两个人就躲在那个影子里面。那么炸弹，它来炸了三批，那一批走了以后，我们又爬起来跑，跑到听见飞机，看到来了，我们又躲起来了。
轰炸结束后，经过土木系学生的测量，日军在标营学生宿舍共投弹118枚，二至四年级的男生宿舍，全部被炸毁。
而且据有些回忆讲，那一天的轰炸很怪，来了以后，在宜山城区没有丢炸弹，直接就狂轰乱卸地，直接就奔着浙大来的啦。就是说有内奸，恐怕报告了浙江大学就在这个位置，日本人专门是冲着浙江大学来投炸弹的。
在这次轰炸中，宜山市民死伤50多人，国立浙江大学共计损失3万多元，但师生无一伤亡。
王人龙后来说笑话嘛，说这个日本的航空员都是斗鸡眼，都是斜眼，眼睛斜的，斜视的，对不准。其实，对准没法对准，不可能一个人扔一个炸弹，它是炸弹一大批下来。
这里面有一个插曲，他们原来班上有一个，工学院的同学叫孙华，无锡人，他是神精病了，不知道怎么样得来的，那时候没有办法管理他的，把他隔离在农场里边哪一个房间里，关在里边。经过这次大轰炸以后，他忽然跑出来了，说好了，大家都觉得很奇怪的，就