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最早的哺乳动物在三叠纪晚期由爬行动物中的真犬齿兽类演化而来。
在晚三叠纪的卡尼克阶，大约2亿2千万年前，出现了真正的哺乳类。
犬齿兽进化成哺乳类，可能是习惯晚上行动。为了在夜间生存，原始的哺乳类必须在夜间增加它们的新陈代谢率以维持体温。这意味者更快地消耗食物多以昆虫为食。为了促进快速消化，原始的哺乳类演化出咀嚼与特殊化的牙齿来协助咀嚼。脚臂也演化到身体底下而不是身体两侧。这让原始哺乳类能更快改变方向以抓住小型猎物。与快速奔跑的猎食者相比，原始哺乳类改采机动性的策略。
有时生物的自然选择某种程度上与量子理论的原理差不多。自然界当时有各种从大到小的体形的各种动物，提供了几乎所有可能的选择样本，类似于量子理论的无限可能性。为什么自然选择了老鼠般大小的哺乳动物活了下来，并且发达起来，成为现代哺乳动物的祖先，这真的很奇妙。具体的原因后面会详细介绍。
三叠纪早期初龙下纲出现。槽齿目是三叠纪早期出现的初龙类型，到三叠纪晚期，恐龙总目的鸟臀目、兽脚亚目和蜥脚亚目出现。初龙亚纲成为陆地优势动物。而初龙亚纲中的恐龙成为三叠纪后期到白纪末期的陆地优势动物群。因此中生代有时被称为“恐龙时代”、“爬行动物时代”。
调孔亚纲的其它门类除了鱼龙目和沧龙科之外都在三叠纪出现。三叠纪陆地上的调孔亚纲面临初龙的竞争，开始返回海洋，调孔亚纲成为海洋优势动物。
调孔亚纲的鱼龙在三叠纪早期完全特化成鱼形，占据海洋优势地位。
鱼龙是高度适应海洋生活的爬行动物，体型似鱼。鱼龙早在2。3亿年前就已经生活在海中，以软体动物为食。鱼龙妈妈在自己体内产卵，当然一次只有一颗卵，并在体内养育到小鱼龙孵化出来。它们的孩子出世后，终身都生活在海洋里。它们在大海中过得非常自在，有些鱼龙可以长到13米多。
三叠纪出现的蛇颈龙的外形像一条蛇穿过一个乌龟壳：头小，颈长，躯干像乌龟，尾巴短。头虽然偏小，但口很大，口内长有很多细长的锥形牙齿，捕鱼为生。许多种类的身体非常庞大，长达1115米，个别种类达18米。四肢特化为适于划水的肉质鳍脚，使蛇颈龙既能在水中往来自如，又能爬上岸。与鱼龙繁育后代的方式是一样的。蛇颈龙可能是我国神话传说中真武大帝的原型。或许是先民发现了蛇颈龙的骨架化石，将其供奉起来，进行祭祀。
鳞龙下纲包括现存爬行动物的绝大多数成员。包括楔齿、蜥蜴、变色龙、壁虎和蛇等。
三叠纪至之交的生物大绝灭2。08亿年前。这次灾难造成了60个科的海洋生物灭绝，科的灭绝率大约是14。牙形石类全部灭绝；菊石、海绵动物、头足类动物、腕足动物、昆虫的多个门类灭绝。初龙下纲中的槽齿类绝灭，调孔亚纲的幻龙类也绝灭了。
虽然这次大绝灭的损失相对较小，但却腾出了许多“生态位”，为很多新的物种的产生提供了有利的条件。恐龙就是从这个时候开始了它们统治大地的征程。
在三叠纪末期，先是出现了全球的干冷陆地上的大旱，海平面大幅下降，继而又出现温度发生显著上升，引起海平面大幅上升大陆上出现大幅降雨引起洪涝灾害的典型现象。同时伴随着海水严重缺氧的现象发生。这种两幕式灾难的上演与奥陶纪冰期灭绝事件的现象很相似。
海洋生物因为本来抗风险能力就因为盘古大陆的存在使得大陆架面积过少，而缺乏生存空间。所以一旦发生风吹草去就容易被摧毁。而大陆上因为环境变化不大。所以损失也不大。
这次灾难之后，海洋被清空，调孔亚纲在海洋中的发展空间更大了。而陆地上的初龙下纲的发展空间也更大了。
下一章介绍爬行动物全面发展的侏罗纪。
第十章 侏罗纪（）
约2亿年前1。46亿年前是裸子植物的极盛期。
无脊椎动物以菊石、双壳类、箭石、腹足类、叶肢介、介形虫、六射珊瑚、棘皮动物的海胆为主。
软骨硬鳞鱼类在侏罗纪已开始衰退，被全骨鱼代替。
晚期出现的一部分最原始的哺乳动物，经过侏罗纪早期的多样性发展，发展出许多新的门类。其中以多瘤齿兽类为主要的植食性哺乳动物；侏罗纪中期出现的古兽类是有袋类和有胎盘哺乳动物的祖先。
但是在肉食性恐龙的威胁下，大多数哺乳动物在侏罗纪晚期已濒于绝灭，所有的大型动物都被肉食性恐龙淘汰了。当时君临陆地的大小恐龙占据了绝大部分的生态位。
侏罗纪晚期出现了最早的有胎盘哺乳动物，这些动物属于食虫目。食虫动物体型多如小鼠或小型大鼠，主要以昆虫、其他节肢动物和蚯蚓维生。食肉目、翼手目、啮齿目都是由早期的食虫目分化出来的。食虫目包括猬、金鼹、鼹鼠、鼩鼱、刺毛鼩猬、毛猬、古巴鼩和马达加斯加猬，现代的刺猬是它们的后裔。
习惯夜间生活的哺乳动物昼间生活的都已经被淘汰，避开了白日恐龙的袭击，适应夜间生活的温血体质冷血动物夜间会冻死，能够躲在地下洞穴中的老鼠般大小的身体大的哺乳动物已经送到了恐龙的嘴里，且食量很小食量多的进食时间太长，以致需要在洞外活动更长时间，增加了遇到敌人的危险，可以很快填饱肚子。这些特点使得其在侏罗纪和的漫长时间中发展了庞大的数量，以致能够有少部分逃过白纪末期恐龙灭绝的灾难。
恐龙的另一类型蜥臀类在侏罗纪有两类最为繁盛：一类是食肉的恐龙，另一类是笨重的植食恐龙。
海生的爬行类中主要是鱼龙及蛇颈龙，它们成为海洋环境中不可忽视的成员。
恐龙成为陆地的统治者。鸟臀类恐龙除一些早期类群外，都是四足行走，并且全都是吃植物的。由于鸟臀类恐龙性情温和，不具进攻性因而往往成为肉食性恐龙的果腹之物。
剑龙类，四足行走背部具有直立的骨板，尾部有骨质刺棒两对。
甲龙类的恐龙体形低矮粗壮，全身披有骨质甲板，以植物为食。
角龙类，是四足行走的素食恐龙。头骨后部扩大成颈盾。
肿头龙类主要特点是头骨肿厚，颥孔封闭，骨盘中耻骨被坐骨排挤，不参与组成腰带。
兽脚亚目特征：肉食性，两足行走，趾端长有锐利的爪子，嘴里长着匕首或小刀一样的利齿，牙齿前后缘常有锯齿。暴龙是其著名代表。
巨大凶残的霸王龙进化最完美，攻击力最强，没有什么弱点，身体非常粗壮，娇小矫健的迅猛龙，外形怪异而极其巨大的棘龙地球历史上出现过的最大的肉食性动物，这些恐龙都是兽脚类恐龙。
兽脚类恐龙的前肢活动范围不大，无法前后转动它们的手掌，手掌只能朝下或朝后。其腕部关节的活动方向、活动范围也有限。
蜥脚亚目与兽脚亚目不同的是，它们全都是植食性恐龙。这类恐龙中有的体长达到了40米，体重100吨，是地球上曾经生活过的最大生物。
蜥脚亚目为四足行走的素食性巨型恐龙，生活在沼泽河湖周围，并可在水中躲藏，以避敌害。分为棒齿蜥龙科群和勺状蜥龙科群。前者分为马门溪龙科、雷龙科、梁龙科、巨龙科、叉龙科。后者分为盘足龙科、妖龙科、腕龙科、圆顶龙科。
侏罗纪晚期，生态竞争异常激烈。部分兽脚亚目恐龙为了逃避其它肉食恐龙的威胁，通过千万年计的不断地奔跑、跳跃，从原来的陆上生活，开始爬树，改为树栖，再改为在树上跳跃，再进化为在树枝之间滑翔，最后直到能够真正飞翔起来，从而进化为鸟类。
翼龙类和鸟类出现，这是动物生命史上的重要变革之一。
鸟纲分为古鸟亚纲、反鸟亚纲和今鸟亚纲。古鸟亚纲全部为化石鸟类，包括始祖鸟等。反鸟亚纲全部为化石鸟类，包括三塔中国鸟、朝阳鸟、辽宁鸟等。今鸟亚纲新鸟亚纲包括白纪的化石鸟类和现存的全部鸟类。
古鸟亚纲的始祖鸟是爬行动物与鸟类之间的中间环节。始祖鸟是鸟类的祖先，并生活于侏罗纪的启莫里阶，距今约1亿5千5百万到1亿5千万年前。始祖鸟约为现今鸟类的中型大小，有著阔及于末端圆形的翅膀，并比体型较长的尾巴，始祖鸟有细小的牙齿可以用来捕猎昆虫